Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smad9Q9JIW5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad9Q9JIW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms