Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc12a4Q9JIS8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms