Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1fQ9JIS7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms