Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus3Q9JI38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms