Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HpgdsQ9JHF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpgdsQ9JHF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms