Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcirg1Q9JHF5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms