Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc4Q9ES56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc4Q9ES56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms