Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvgQ9ERD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ParvgQ9ERD8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParvgQ9ERD8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParvgQ9ERD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParvgQ9ERD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ParvgQ9ERD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms