Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall1Q9ER74 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall1Q9ER74 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms