Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn2Q9ER65 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn2Q9ER65 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms