Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rapgef4Q9EQZ6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef4Q9EQZ6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef4Q9EQZ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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