Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnn1Q9EQR3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnn1Q9EQR3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnn1Q9EQR3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnn1Q9EQR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnn1Q9EQR3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms