Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpsf1Q9EPU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpsf1Q9EPU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cpsf1Q9EPU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms