Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpr88Q9EPB7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpr88Q9EPB7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr88Q9EPB7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms