Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TnmdQ9EP64 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnmdQ9EP64 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms