Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r50Q9EP51 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r50Q9EP51 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r50Q9EP51 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms