Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms