Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT9

Dmgdh, Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmgdhQ9DBT9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmgdhQ9DBT9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmgdhQ9DBT9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms