Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp27a1Q9DBG1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp27a1Q9DBG1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms