Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftsj3Q9DBE9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms