Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s2Q9DB50 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms