Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med27Q9DB40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med27Q9DB40 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms