Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn3Q9DAW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms