Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnpy3Q9DAU1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnpy3Q9DAU1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms