Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc54Q9DAL3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc54Q9DAL3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc54Q9DAL3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms