Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms