Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp4bQ9D8B3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms