Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slx4ipQ9D7Y9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4ipQ9D7Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms