Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tspan17Q9D7W4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms