Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd2Q9D7V2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd2Q9D7V2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms