Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp5Q9D7S9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms