Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capns2Q9D7J7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms