Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl40Q9D783 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl40Q9D783 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms