Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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