Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip1Q9D620 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rab11fip1Q9D620 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Rab11fip1Q9D620 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rab11fip1Q9D620 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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