Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc81Q9D5W4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc81Q9D5W4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc81Q9D5W4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms