Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul5Q9D5V5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms