Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn11Q9D572 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn11Q9D572 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn11Q9D572 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms