Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc7Q9D541 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7Q9D541 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms