Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc130Q9D516 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms