Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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Ribc2Q9D4Q1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ribc2Q9D4Q1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ribc2Q9D4Q1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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