Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gcc1Q9D4H2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcc1Q9D4H2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms