Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmntd1Q9D4C1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmntd1Q9D4C1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms