Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stag1Q9D3E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stag1Q9D3E6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stag1Q9D3E6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms