Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lamp5Q9D387 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp5Q9D387 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms