Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Obox1Q9D350 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms