Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700034E13RikQ9D2T6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms