Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt44Q9D2Q2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt44Q9D2Q2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt44Q9D2Q2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms