Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D930007J09RikQ9D2K6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
D930007J09RikQ9D2K6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D930007J09RikQ9D2K6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
D930007J09RikQ9D2K6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms