Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6bQ9D289 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms